内贸海运集装箱市场的以国有性子的航运公司为主，，私营内贸航运公司也获得蓬勃开展，，尤其是2008年在金融；；；墓セ飨，，远洋运输一蹶不振。而我海内贸集装箱运输市场一枝独秀，，内贸集装箱运输市场迎来快速开展，，但同样我海内贸海运集装箱运输开展中也保存的问题。

（1）内贸集装箱运输治理机制不健全
（2）缺乏有用的理货机制。外贸集装箱运输在海关系统的严酷要求和治理下，，其理货机制是很完善的。但内贸集装箱运输却基础没有理货这个程序。理货机制的缺失带来了几个严重的问题：：：
       A.泛起货损的执法空缺。由于没有理货机制，，货主、、口岸、、收货人往往会由于某种原因造成的货物缺失而爆发争议，，但却没有有用的文件来证实或澄清。
       B.不可对危险品举行有用监控。在没有理货监视的条件下，，部分货主就可以不报、、瞒报危险品，，或者夹带危险品，，从而为运输清静带来了严重隐患，，极大地威胁到人民生命工业的清静。
       C.内贸集装箱运输超载征象严重，，内贸集装箱运输超载是市场保存的主要问题之一。内贸集装箱运输中货主为了节约运费获得较大利润，，主观上希望最大限度地使用集装箱的空间。由于内贸集装箱货物种类繁多，，甚至大宗的建材、、焦炭以及粮食都接纳集装箱运输，，因此就很容易造成内贸集装箱的严重超重，，现在这种征象在我国口岸普遍保存，，但由于口岸区域之间竞争因素大多接纳忍让的态度。
（3）内贸单证系统不完善现在，，内贸集装箱运输系统保存着严重的单证系统不完善的问题，，主要体现为：：：差别的口岸有着差别的单证，，差别的船公司其单证也纷歧致。
（4）内贸集装箱运输价钱系统不健全，，交通部在内贸集装箱开展初期制订了内贸口岸有关收费的规则，，明确划定了口岸关于内贸集装箱的收费标准。可是，，这一标准严重低于外贸，，基本上是外贸集装箱相关收费的一半。但随着内贸集装箱运输的开展这样的价钱机制已成为了内贸集装箱开展的制约因素。同时由于内贸集装箱运价没有一个有用的监视机制，，船公司之间在统一航线上的价钱恶性竞争，，也影响了内贸集装箱运输市场的康健开展。
（5）内贸水路集装箱运输市场准入机制需要调解
从口岸层面来看，，部分口岸原先是从事外贸集装箱营业的，，转为内贸集装箱码头或内外贸兼作的码头后，，仍然能够包管拥有较完整的码头基础设施和治理系统。但部分中小内贸集装箱码头在基础设施条件和治理系统方面则有着很大的差别，，闸口系统、、信息系统、、安保系统等都不健全。从船公司的层面来看，，水陆内贸集装箱运输市场的门槛要远低于外贸集装箱运输，，因而泛起内贸水陆运输市场船型混杂，，质量狼籍不齐，，公司的运营治理系统也千差万别，，这也是导致运价市场杂乱的部分原因之一。
（6）内贸集装箱运输基础设施水平落伍，，装卸费率偏低。现在，，我海内贸集装箱运输口岸的基础设施水平还很是落伍，，内贸海运大部分码头由杂货码头刷新而成，，基础条件要远落伍于外贸集装箱码头，，极大地影响了内贸集装箱运输向更高层面的开展。码头装卸作业，，内、、外贸集装箱在码头的装卸本钱险些相同，，可是装卸费率却仅有外贸集装箱装卸费率的1/2，，加上油价的涨幅和人工用度，，这就给内贸集装箱码头带来了较大的本钱压力，，码头治理方也不肯意破费高昂的价钱来更新基础设施